Global Patent Index - EP 3708663 A1

EP 3708663 A1 20200916 - NUCLEASE-MEDIATED DNA ASSEMBLY

Title (en)

NUCLEASE-MEDIATED DNA ASSEMBLY

Title (de)

NUKLEASE-VERMITTELTE DNA VERKNÜPFUNG

Title (fr)

ASSEMBLAGE D'ADN MEDIÉE PAR NUCLEASE

Publication

EP 3708663 A1 20200916 (EN)

Application

EP 19218837 A 20150623

Priority

  • US 201462015809 P 20140623
  • US 201462016400 P 20140624
  • US 201462036983 P 20140813
  • EP 18162656 A 20150623
  • EP 15735807 A 20150623
  • US 2015037199 W 20150623

Abstract (en)

Methods are provided herein for assembling at least two nucleic acids using a sequence specific nuclease agent (e.g., a gRNA-Cas complex) to create end sequences having complementarity and subsequently assembling the overlapping complementary sequences. The nuclease agent (e.g., a gRNA-Cas complex) can create double strand breaks in dsDNA in order to create overlapping end sequences or can create nicks on each strand to produce complementary overhanging end sequences. Assembly using the method described herein can assemble any nucleic acids having overlapping sequences or can use a joiner oligo to assemble sequences without complementary ends.

IPC 8 full level

C12N 15/10 (2006.01); C12N 15/64 (2006.01); C12N 15/66 (2006.01)

CPC (source: EP IL KR RU US)

C12N 15/10 (2013.01 - RU); C12N 15/1031 (2013.01 - EP IL KR US); C12N 15/64 (2013.01 - EP IL KR RU US); C12N 15/66 (2013.01 - EP IL KR US)

Citation (applicant)

Citation (search report)

  • [I] US 2010035768 A1 20100211 - GIBSON DANIEL G [US], et al
  • [I] DANIEL G GIBSON ET AL: "Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases", NATURE METHODS, NATURE PUBLISHING GROUP, GB, no. 5, 1 May 2009 (2009-05-01), pages 343 - 345, XP002637812, ISSN: 1548-7091, [retrieved on 20090412], DOI: 10.1038/NMETH.1318 & DANIEL G GIBSON ET AL: "Supplementary material for: Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases", NATURE METHODS, vol. 6, no. 5, 12 April 2009 (2009-04-12), pages 1 - 12, XP055213878, ISSN: 1548-7091, DOI: 10.1038/nmeth.1318
  • [I] ADI RAMON ET AL: "Single-step linker-based combinatorial assembly of promoter and gene cassettes for pathway engineering", BIOTECHNOLOGY LETTERS, SPRINGER NETHERLANDS, DORDRECHT, vol. 33, no. 3, 24 November 2010 (2010-11-24), pages 549 - 555, XP019883187, ISSN: 1573-6776, DOI: 10.1007/S10529-010-0455-X
  • [XP] JIA-WANG WANG ET AL: "CRISPR/Cas9 nuclease cleavage combined with Gibson assembly for seamless cloning", BIOTECHNIQUES, 1 April 2015 (2015-04-01), England, pages 161, XP055213773, Retrieved from the Internet <URL:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25861928> DOI: 10.2144/000114261 & JIA-WANG WANG ET AL: "Supplementary material for: CRISPR/Cas9 nuclease cleavage combined with Gibson assembly for seamless cloning", BIOTECHNIQUES, 1 April 2015 (2015-04-01), England, pages 1 - 2, XP055213775, Retrieved from the Internet <URL:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25861928> [retrieved on 20150916], DOI: 10.2144/000114261

Designated contracting state (EPC)

AL AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LI LT LU LV MC MK MT NL NO PL PT RO RS SE SI SK SM TR

DOCDB simple family (publication)

US 2015376628 A1 20151231; US 9738897 B2 20170822; AU 2015280120 A1 20170119; AU 2015280120 B2 20170525; AU 2017213564 A1 20170831; AU 2017213564 B2 20181018; AU 2019200094 A1 20190131; AU 2019200094 B2 20210624; BR 112016030145 A2 20180220; BR 112016030145 A8 20181211; CA 2953499 A1 20151230; CA 2953499 C 20231024; CN 106715694 A 20170524; CN 106715694 B 20201020; CN 112029787 A 20201204; CY 1120520 T1 20190710; CY 1122962 T1 20211029; DK 3155099 T3 20180507; DK 3354732 T3 20200406; EP 3155099 A1 20170419; EP 3155099 B1 20180321; EP 3354732 A1 20180801; EP 3354732 B1 20200108; EP 3708663 A1 20200916; ES 2666179 T3 20180503; ES 2781323 T3 20200901; HK 1256688 A1 20191004; HR P20200523 T1 20200807; HU E049405 T2 20200928; IL 249612 A0 20170228; IL 249612 B 20210429; JP 2017113031 A 20170629; JP 2017518757 A 20170713; JP 2020120662 A 20200813; JP 2020202836 A 20201224; JP 6336140 B2 20180606; JP 6684241 B2 20200422; JP 6737974 B1 20200812; JP 7058306 B2 20220421; KR 101822902 B1 20180130; KR 102237151 B1 20210407; KR 20170020505 A 20170222; KR 20180011858 A 20180202; LT 3354732 T 20200410; MX 2016016905 A 20170810; MX 2021000857 A 20210728; NZ 727952 A 20211126; NZ 765591 A 20220930; PL 3155099 T3 20180831; PL 3354732 T3 20200615; PT 3155099 T 20180420; PT 3354732 T 20200402; RS 60366 B1 20200731; RU 2017101329 A 20180724; RU 2017101329 A3 20190215; RU 2707911 C2 20191202; SG 10201803444Y A 20180628; SG 11201610481Y A 20170127; SI 3354732 T1 20200731; US 10273488 B2 20190430; US 10626402 B2 20200421; US 11932859 B2 20240319; US 2016115486 A1 20160428; US 2018002708 A1 20180104; US 2019194668 A1 20190627; US 2020208161 A1 20200702; US 9580715 B2 20170228; WO 2015200334 A1 20151230; WO 2015200334 A4 20160317

DOCDB simple family (application)

US 201514747461 A 20150623; AU 2015280120 A 20150623; AU 2017213564 A 20170811; AU 2019200094 A 20190108; BR 112016030145 A 20150623; CA 2953499 A 20150623; CN 201580045198 A 20150623; CN 202010960987 A 20150623; CY 181100409 T 20180417; CY 201100288 T 20200327; DK 15735807 T 20150623; DK 18162656 T 20150623; EP 15735807 A 20150623; EP 18162656 A 20150623; EP 19218837 A 20150623; ES 15735807 T 20150623; ES 18162656 T 20150623; HK 18115673 A 20181206; HR P20200523 T 20200330; HU E18162656 A 20150623; IL 24961216 A 20161218; JP 2016575030 A 20150623; JP 2017055763 A 20170322; JP 2020057300 A 20200327; JP 2020121876 A 20200716; KR 20177001792 A 20150623; KR 20187002009 A 20150623; LT 18162656 T 20150623; MX 2016016905 A 20150623; MX 2021000857 A 20150623; NZ 72795215 A 20150623; NZ 76559115 A 20150623; PL 15735807 T 20150623; PL 18162656 T 20150623; PT 15735807 T 20150623; PT 18162656 T 20150623; RS P20200351 A 20150623; RU 2017101329 A 20150623; SG 10201803444Y A 20150623; SG 11201610481Y A 20150623; SI 201531144 T 20150623; US 2015037199 W 20150623; US 201514926720 A 20151029; US 201715638832 A 20170630; US 201916296003 A 20190307; US 202016815194 A 20200311