Global Patent Index - EP 3954225 A1

EP 3954225 A1 20220216 - COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIZING 5'-CAPPED RNAS

Title (en)

COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIZING 5'-CAPPED RNAS

Title (de)

ZUSAMMENSETZUNGEN UND VERFAHREN ZUR SYNTHESE VON 5'-VERKAPPTEN RNAS

Title (fr)

COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE D'ARN COIFFÉS EN 5'

Publication

EP 3954225 A1 20220216 (EN)

Application

EP 21173142 A 20160920

Priority

  • US 201562221248 P 20150921
  • US 2016052670 W 20160920
  • EP 16849423 A 20160920

Abstract (en)

Provided herein are methods and compositions for synthesizing 5'Capped RNAs wherein the initiating capped oligonucleotide primers have the general form <sup>m7</sup>Gppp[N<sub>2'Ome</sub>]<sub>n</sub>[N]<sub>m</sub> wherein <sup>m7</sup>G is N7-methylated guanosine or any guanosine analog, N is any natural, modified or unnatural nucleoside, "n" can be any integer from 0 to 4 and "m" can be an integer from 1 to 9.

IPC 8 full level

A23L 33/13 (2016.01); A61K 31/711 (2006.01); A61K 31/7115 (2006.01); A61K 31/712 (2006.01); C07H 21/02 (2006.01); C12N 15/11 (2006.01); C12P 19/34 (2006.01)

CPC (source: CN EP KR US)

A23L 33/13 (2016.08 - US); A61K 31/711 (2013.01 - EP US); A61K 31/7115 (2013.01 - EP US); A61K 31/712 (2013.01 - EP US); C07H 21/02 (2013.01 - CN EP KR US); C12N 15/11 (2013.01 - CN KR US); C12P 19/34 (2013.01 - CN US); C12N 2310/3533 (2013.01 - KR); C12P 19/34 (2013.01 - EP); C12Y 207/07 (2013.01 - EP US)

Citation (applicant)

  • US 7074596 B2 20060711 - DARZYNKIEWICZ EDWARD [PL], et al
  • US 8344118 B2 20130101 - KORE ANILKUMAR [US], et al
  • US 2007281308 A1 20071206 - ZON GERALD [US], et al
  • US 6762298 B2 20040713 - BEAUCAGE SERGE L [US], et al
  • US 2012156751 A1 20120621 - KORE ANILKUMAR [US], et al
  • CELL, vol. 9, 1976, pages 645 - 653
  • NATURE, vol. 266, 1977, pages 235
  • FEDERATION OF EXPERIMENTAL BIOLOGISTS SOCIETY LETTER, vol. 96, 1978, pages 1 - 11
  • CELL, vol. 40, 1985, pages 223 - 24
  • PROG. NUC. ACID RES., vol. 35, 1988, pages 173 - 207
  • ANN. REV. BIOCHEM., vol. 68, 1999, pages 913 - 963
  • J. BIOL. CHEM., vol. 274, 1999, pages 30337 - 3040
  • NATURE, vol. 255, 1975, pages 33 - 37
  • J. BIOL. CHEM., vol. 253, 1978, pages 5228 - 5231
  • PROC. NATL. ACAD. SCI. USA, vol. 72, 1975, pages 1189 - 1193
  • PROC. NATL. ACAD. SCI. USA, vol. 77, 1980, pages 3952 - 3956
  • NUCLEIC ACID RESEARCH, vol. 43, 2015, pages 482 - 492
  • J. BIOL. CHEM., vol. 250, 1975, pages 9322
  • J. BIOL. CHEM., vol. 271, 1996, pages 11936 - 11944
  • J. BIOL. CHEM., vol. 267, 1992, pages 16430
  • PROG. NUCLEIC ACID RES. MOL. BIOL., vol. 66, 2001, pages 1 - 40
  • PROG. NUCLEIC ACID RES. MOL. BIOL., vol. 50, 1995, pages 101 - 129
  • MICROBIOL. REV., vol. 44, 1980, pages 175
  • J. BIOL. CHEM., vol. 269, 1994, pages 14974 - 14981
  • J. BIOL. CHEM., vol. 255, 1980, pages 11588
  • PROC. NATL. ACAD. SCI. USA, vol. 94, 1997, pages 9573
  • EMBO, vol. 21, 2002, pages 2757 - 2768
  • NUCLEIC ACIDS RES., vol. 26, 1998, pages 3208
  • NUCLEIC ACIDS RES., vol. 39, 2011, pages 4756
  • METHODS ENZYMOL., vol. 180, 1989, pages 51 - 62
  • NUCL. ACIDS RES., vol. 10, 1982, pages 6353 - 6362
  • METH. ENZYMOL.,, vol. 180, 1989, pages 42 - 50
  • NUCL. ACIDS RES., vol. 12, 1984, pages 7035 - 7056
  • NUCLEIC ACID RESEARCH, vol. 15, 1987, pages 8783 - 8798
  • RNA, vol. 7, 2001, pages 1486 - 1495
  • NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES, AND NUCLEIC ACIDS, vol. 25, no. 3, 2006, pages 307 - 340
  • J. GEN. VIROL., vol. 91, 2010, pages 112 - 121
  • SAMBROOK ET AL.: "Molecular Cloning: A Laboratory Manua", 1989, COLD SPRING HARBOR PRESS
  • STEC, W.J. ET AL., CHEM. INT. ED. ENGL., vol. 33, 1994, pages 709 - 722
  • LOAKES, D., NUCLEIC ACIDS RES., vol. 29, 2001, pages 2437 - 2447
  • CREY-DESBIOLLES, C., NUCLEIC ACIDS RES., vol. 33, 2005, pages 2620 - 2628
  • PREPARATA, FPOLIVER, JS, J. COMPUT. BIOL., 2004, pages 753 - 765
  • HILL, F., PROC NATL ACAD. SCI. USA, vol. 95, 1998, pages 4258 - 4263
  • NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATES AND THEIR ANALOGS: CHEMISTRY, BIOTECHNOLOGY AND BIOLOGICAL APPLICATIONS, 2005
  • LEBEDEV, A.V. ET AL., E., PERSPECT. DRUG DISCOV. DES.,, vol. 4, 1996, pages 17 - 40
  • WALDNER ET AL., BIOORG. MED. CHEM. LETTERS, vol. 6, 1996, pages 2363 - 2366
  • BIOCHEMISTRY, vol. 19, 1980, pages 3245 - 3253
  • NUCLEIC ACIDS RES., vol. 9, 1981, pages 31 - 45
  • NUCLEIC ACIDS RES., vol. 15, 1987, pages 8783 - 8798
  • BIOCHEMISTRY, vol. 27, 1988, pages 3966 - 3974
  • J. MOL. BIOL., vol. 183, 1985, pages 165 - 177
  • PROC. NATL. ACAD. SCI. U. S. A., vol. 83, 1986, pages 3614 - 3618
  • MOL. CELL BIOL., vol. 7, 1987, pages 3371 - 3379
  • CELL, vol. 16, 1979, pages 815 - 25
  • J. MOL. BIOL., vol. 370, 2007, pages 256 - 268
  • J. BIOL. CHEM., vol. 248, 1973, pages 2235 - 2244
  • J. BIOL. CHEM., vol. 278, 2003, pages 2819 - 2823
  • BIOCHEMISTRY, vol. 24, 1985, pages 5716 - 5723
  • PITULLE, C ET AL., GENE, vol. 112, 1992, pages 101 - 105
  • METHODS MOL BIO, vol. 1, no. 74, 1997, pages 99 - 110
  • METHODS MOL. BIOL., vol. 252, 2004, pages 9 - 17
  • NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 21, 1993, pages 1097 - 1101
  • METHODS MOL. BIOL, vol. 74, 1997, pages 99 - 110
  • ISHICAWA ET AL., NUCLEIC ACIDS SYMPOSIUM SERIES, vol. 53, no. 53, 2009, pages 129
  • RNA, vol. 1, 1995, pages 957 - 967
  • OHKUBO ET AL., ORG. LETTERS, vol. 15, 2013, pages 4386 - 4389
  • BIOCONJUG. CHEM., vol. 10371, 1999, pages 378
  • NUCLEIC ACIDS RES., vol. 36, 2008, pages e131
  • COLLECT. SYMP. SER., vol. 10, 2008, pages 259 - 263
  • ANALYTICAL CHEMISTRY, vol. 81, 2009, pages 4955 - 4962
  • "Remington's Pharmaceutical Sciences", 1995, WILLIAMS & WILKINS
  • BIOORGAN. MED. CHEM. LETTERS, vol. 17, 2007, pages 5295 - 5299
  • NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES, AND NUCLEIC ACIDS, vol. 24, 2005, pages 1131 - 1134
  • J. ORG. CHEM., vol. 64, 1999, pages 5836 - 5840
  • RNA, vol. 9, 2003, pages 1108 - 1122
  • NUCLEOSIDE NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS, vol. 25, 2006, pages 337 - 340
  • RNA, vol. 14, 2008, pages 1119 - 1131
  • ORG. BIOMOL. CHEM., vol. 3, 2005, pages 3851 - 3868
  • NUCL. ACIDS RES., vol. 22, 1994, pages 2430 - 2431
  • BIOORG. MED. CHEM. LETT., vol. 17, 2007, pages 5295 - 5299
  • BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY, vol. 21, 2013, pages 7921 - 7928
  • NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 37, 2009, pages 1925 - 1935
  • ISHICAWA ET AL., NUCLEIC ACIDS SYMPOSIUM, vol. 53, 2009, pages 129

Citation (search report)

  • [Y] WO 2008016473 A2 20080207 - APPLERA CORP [US], et al
  • [Y] WO 2009058911 A2 20090507 - APPLIED BIOSYSTEMS [US], et al
  • [Y] Y. THILLIER ET AL: "Synthesis of 5' cap-0 and cap-1 RNAs using solid-phase chemistry coupled with enzymatic methylation by human (guanine-N7)-methyl transferase", RNA, vol. 18, no. 4, 14 February 2012 (2012-02-14), US, pages 856 - 868, XP055553150, ISSN: 1355-8382, DOI: 10.1261/rna.030932.111
  • [Y] HIROAKI SAWAI ET AL: "Synthesis and Reactions of Nucleoside 5'-Diphosphate Imidazolide. A Nonenzymatic Capping Agent for 5'-Monophosphorylated Oligoribonucleotides in Aqueous Solution", JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, vol. 64, no. 16, 1 August 1999 (1999-08-01), pages 5836 - 5840, XP055331109, ISSN: 0022-3263, DOI: 10.1021/jo990286u
  • [Y] I. I. KOUKHAREVA ET AL: "Chemical Route to the Capped RNAs", NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS., vol. 23, no. 10, 1 January 2004 (2004-01-01), US, pages 1667 - 1680, XP055553747, ISSN: 1525-7770, DOI: 10.1081/NCN-200031492
  • [Y] ROBERT E. SMITH ET AL: "A Unique Class of Compound, Guanosine-Nucleoside Tetraphosphate G(5')pppp(5')N, Synthesized during the in Vitro Transcription of Cytoplasmic Polyhedrosis Virus of Bombyx mori STRUCTURAL DETERMINATION AND MECHANISM OF FORMATION*", THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, vol. 257, no. 1, 1 January 1982 (1982-01-01), pages 485 - 494, XP055331398

Designated contracting state (EPC)

AL AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LI LT LU LV MC MK MT NL NO PL PT RO RS SE SI SK SM TR

DOCDB simple family (publication)

WO 2017053297 A1 20170330; AU 2016328645 A1 20180419; AU 2016328645 B2 20210513; AU 2016328645 C1 20211028; AU 2021206780 A1 20210812; AU 2021206780 B2 20230406; AU 2021206780 C1 20240104; AU 2023201915 A1 20230504; AU 2023229522 A1 20230928; CA 2999274 A1 20170330; CA 2999274 C 20231219; CA 3218662 A1 20170330; CN 108366604 A 20180803; CN 113584020 A 20211102; CN 116590285 A 20230815; CN 116751827 A 20230915; CN 116751827 B 20240130; CN 117025590 A 20231110; CY 1124306 T1 20220722; DK 3352584 T3 20210712; DK 3906789 T3 20240108; DK 3954225 T3 20240102; DK 4104687 T3 20240304; DK 4140491 T3 20231127; EP 3352584 A1 20180801; EP 3352584 A4 20190327; EP 3352584 B1 20210512; EP 3906789 A1 20211110; EP 3906789 B1 20231122; EP 3954224 A1 20220216; EP 3954225 A1 20220216; EP 3954225 B1 20231122; EP 4104687 A1 20221221; EP 4104687 B1 20240131; EP 4140491 A1 20230301; EP 4140491 B1 20230913; EP 4276189 A2 20231115; EP 4276189 A3 20240117; ES 2879686 T3 20211122; ES 2964690 T3 20240409; ES 2968335 T3 20240509; ES 2968391 T3 20240509; ES 2972098 T3 20240611; FI 3906789 T3 20240111; FI 3954225 T3 20231228; FI 4104687 T3 20240301; FI 4140491 T3 20231120; HK 1255236 A1 20190809; HR P20211091 T1 20211015; HU E055458 T2 20211129; HU E064227 T2 20240228; HU E065203 T2 20240528; HU E065331 T2 20240528; JP 2018527015 A 20180920; JP 2021048864 A 20210401; JP 2022109973 A 20220728; JP 6814997 B2 20210120; JP 7082174 B2 20220607; KR 102500198 B1 20230216; KR 102670937 B1 20240531; KR 20180050409 A 20180514; KR 20230026535 A 20230224; LT 3352584 T 20210810; LT 3906789 T 20240212; LT 3954225 T 20240212; LT 4104687 T 20240226; LT 4140491 T 20231110; PL 3352584 T3 20211108; PL 3906789 T3 20240520; PL 3954225 T3 20240520; PL 4104687 T3 20240527; PL 4140491 T3 20240226; PT 3352584 T 20210713; PT 3906789 T 20231218; PT 3954225 T 20240102; PT 4104687 T 20240227; PT 4140491 T 20231205; RS 62129 B1 20210831; SI 3352584 T1 20210930; SI 3906789 T1 20240329; SI 3954225 T1 20240329; SI 4104687 T1 20240329; SI 4140491 T1 20240131; US 10494399 B2 20191203; US 10519189 B2 20191231; US 10913768 B2 20210209; US 11414453 B2 20220816; US 11578095 B2 20230214; US 11878991 B2 20240123; US 2018273576 A1 20180927; US 2019144490 A1 20190516; US 2019270766 A1 20190905; US 2021261597 A1 20210826; US 2021371452 A1 20211202; US 2022289786 A1 20220915; US 2024140982 A1 20240502; US 2024158433 A1 20240516

DOCDB simple family (application)

US 2016052670 W 20160920; AU 2016328645 A 20160920; AU 2021206780 A 20210719; AU 2023201915 A 20230329; AU 2023229522 A 20230913; CA 2999274 A 20160920; CA 3218662 A 20160920; CN 201680067458 A 20160920; CN 202110537080 A 20160920; CN 202211046591 A 20160920; CN 202310734863 A 20160920; CN 202311200887 A 20160920; CY 211100612 T 20210707; DK 16849423 T 20160920; DK 21173142 T 20160920; DK 21173278 T 20160920; DK 22175377 T 20160920; DK 22190426 T 20160920; EP 16849423 A 20160920; EP 21173131 A 20160920; EP 21173142 A 20160920; EP 21173278 A 20160920; EP 22175377 A 20160920; EP 22190426 A 20160920; EP 23192203 A 20160920; ES 16849423 T 20160920; ES 21173142 T 20160920; ES 21173278 T 20160920; ES 22175377 T 20160920; ES 22190426 T 20160920; FI 21173142 T 20160920; FI 21173278 T 20160920; FI 22175377 T 20160920; FI 22190426 T 20160920; HK 18114366 A 20181109; HR P20211091 T 20210708; HU E16849423 A 20160920; HU E21173142 A 20160920; HU E21173278 A 20160920; HU E22190426 A 20160920; JP 2018515136 A 20160920; JP 2020204713 A 20201210; JP 2022070512 A 20220422; KR 20187010893 A 20160920; KR 20237004950 A 20160920; LT 16849423 T 20160920; LT 21173142 T 20160920; LT 21173278 T 20160920; LT 22175377 T 20160920; LT 22190426 T 20160920; PL 16849423 T 20160920; PL 21173142 T 20160920; PL 21173278 T 20160920; PL 22175377 T 20160920; PL 22190426 T 20160920; PT 16849423 T 20160920; PT 21173142 T 20160920; PT 21173278 T 20160920; PT 22175377 T 20160920; PT 22190426 T 20160920; RS P20210857 A 20160920; SI 201631248 T 20160920; SI 201631757 T 20160920; SI 201631772 T 20160920; SI 201631773 T 20160920; SI 201631802 T 20160920; US 201615761957 A 20160920; US 201816232435 A 20181226; US 201916371317 A 20190401; US 202017091422 A 20201106; US 202117392170 A 20210802; US 202217804192 A 20220526; US 202318467224 A 20230914; US 202418408431 A 20240109