(19)

(11)

EP 3 307 879 A2

(12)

(88) Date of publication A3: 12.01.2017 (43) Date of publication: 18.04.2018 Bulletin 2018/16 (21) Application number: 16731402.0 (22) Date of filing: 25.05.2016

(51) International Patent Classification (IPC):  C12N 9/10(2006.01) C12N 15/52(2006.01) C12P 13/10(2006.01) C12R 1/19(2006.01) C12N 15/70(2006.01) C12R 1/01(2006.01) (86) International application number: PCT/US2016/034200 (87) International publication number: WO 2016/200614 (15.12.2016 Gazette 2016/50)

(84) Designated Contracting States: AL AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LI LT LU LV MC MK MT NL NO PL PT RO RS SE SI SK SM TR Designated Extension States: BA ME Designated Validation States: MA MD (30) Priority: 10.06.2015 US 201562173710 P 10.06.2015 US 201562173706 P 24.06.2015 US 201562183935 P 25.06.2015 US 201562184770 P 25.06.2015 US 201562184811 P 30.10.2015 US 201562248805 P 16.11.2015 US 201562256041 P 16.11.2015 US 201562256048 P 16.11.2015 US 201562256039 P 04.12.2015 US 201562263329 P 04.12.2015 US 201514960333 12.01.2016 US 201662277654 P 04.02.2016 US 201662291468 P 10.02.2016 US 201662293749 P 02.03.2016 WO PCT/US2016/020530 (71) Applicant: Synlogic, Inc. Cambridge, MA 02139 (US)

(72) Inventors: FALB, Dean Sherborn, MA 01770 (US) ISABELLA, Vincent, M. Cambridge, MA 02139 (US) KOTULA, Jonathan, W. Somerville, MA 02143 (US) MILLER, Paul, F. Salem, CT 06420 (US) MACHINANI, Suman Cambridge, MA 02139 (US) (74) Representative: Murgitroyd & Company  Scotland House 165-169 Scotland Street Glasgow G5 8PL Glasgow G5 8PL (GB)